社会上突然流行蜘蛛女的传说，周刊杂志编辑山崎在大量的信件中发现端倪，他认定这一留言来自这个叫神谷的地方，于是启程前往调查，却踏上了一条诡异的不归路……

在第一部中，正就读中学的少年迈尔斯（沙梅克·摩尔 Shameik Moore 配音）意外被一只遭受放射性污染的蜘蛛咬伤，随后身体发生奇特的变化。偶然机缘，他目睹了蜘蛛侠（克里斯·派恩 Chris Pine 配音）和犯罪头目金并（列维·施瑞博尔 Liev Schreiber 配音）的战斗。为了阻止金并利用时空对撞机扰乱宇宙，蜘蛛侠最终壮烈牺牲。可未过多久，来自平…