鲤之助已经离去很久了，自由也渐渐忘却了以前刺激的经历，但短暂的和平气氛随着一个矮小身躯的神秘人出现在自由家而宣告结束。此人正是鲤之助的孩子鲇之助，拿着心型眼带，为了未来的战斗再次追随着父亲的足迹。而曾经的对手，现在是自由朋友的御影也因担心自由的安危来到她的身边保护她。自由的学校中，新转来一个日俄混血的女孩：菲利莎。谁也…

寒冷的北海道钏路，可爱的高一新生高桥七美（ささきのぞみ 配音）刚刚入学便结实了英俊帅气被全校绝大多数女生喜欢的矢野元晴（矢崎广 配音）。从最初的心存反感到后来的神思牵挂，七美对元晴的情感也悄悄发生着变化。可是，元晴似乎藏着难以为人道的孤独和忧伤。原来他曾有一个相互爱恋的女友山本奈奈（ゆりん 配音），但是一场事故夺去恋人的…

故事讲述了2016年，美国火星探测计划的实现在使探察机发现了火星人的痕迹。但是在收集之后返回地球途中由于故障在经过日本上空是爆炸。向日本落下的碎片所携带的神秘病毒使人类突然变异，这些变异的人被称为“遗迹人”而与之对抗的秘密机关AAST则开发了对遗迹人的特殊防护服...Mars......