警察世家平塚一族，代代均有一个秘密侦探协助他们解决各种棘手疑难案件。这个侦探有些奇怪，他是梨变化出来的妖精，所以叫船梨精。日常里船梨精是在日本家喻户晓的吉祥物，但鲜少有人知道他的真实身份。某天，东京多处发生爆炸事件，百姓陷入前所未有的恐慌之中。未过多久，警察收到了犯人发来的恐吓信，而犯人居然就是30年前制造过爆炸事件的“…

像散落在宇宙的玩偶，变成流星降落到地球上…… 随着时间流逝，现代。被命运选择的少年·礼堂光，得到了不可思议的“银河火花”。 那些变小了的怪兽和奥特战士再次被神秘的物体变回了原来巨大化的姿态。 同时又突然出现了凶恶怪兽和宇宙人！巨大大的黑暗力量开始涌动。 为了保护人类，小光用银河火花的力量将怪兽和奥特战士的玩偶和“ウルトライ…

暗黑路基艾尔在引发的暗黑火花战争中用拥有让所有生物陷入时间停歇的暗黑波动将所有的奥特曼，怪兽和宇宙人变成人偶，后在突然出现的奥特曼银河导致两败俱伤，双方因能力用尽而进入沉睡状态。 人偶变成流星降落到地球上，从外国回来的礼堂光命运般的被选中为奥特曼银河的继承者，同时暗黑路基艾尔正利用着人们心中的黑暗获得邪恶力量想要复活。…

《银河奥特曼》新剧主人公根岸拓哉扮演17岁高中生礼堂光，在所有系列中年龄设定最小。礼堂光在获得“银河奥特曼”的变身器后，将为正义与怪兽、外星人展开搏斗。

沉睡于降星山的六个闪光玩偶突然发出了神秘波动，好像要发生什么大事了。小光通过一场梦境感受了这股神秘波动，泰罗也察觉到了降星山的异常。于是，小光召集其他几位伙伴一起去降星山回收这六个闪光玩偶。结果，众人刚刚抵达降星山就遇到了其他外星人，没想到外星人的目的居然是阻止小光等人回收闪光玩偶。这个外星人是伊卡尔斯星人，它受到神秘…