地球已经很久没有遭受怪兽的侵害了，似乎恢复了和平。人类将目光进一步转向宇宙，因此对抗怪兽灾难的队伍规模也在逐步缩小。而就在这时，神秘宇宙漂浮体“斯菲亚”突然向地球发动攻击。地球与宇宙的联系被斩断，变成了“孤独的行星”。斯菲亚的恶魔之手也逼近了主角明日见奏大的日常生活，它不停地制造着破坏，最终从漂浮体变成了巨大的形态………

特利迦奥特曼与黑暗巨人的战斗结束数年之后，地球再次迎来了和平的年代现在已经基本见不到怪兽的踪影了，怪兽带来的灾害影响也已经渐渐地淡出了人们的视线。人类已经开辟了火星移居地，并打算组建新的队伍开辟第二个火星移居地。地球上的人类开始了探索宇宙的征程，现在进入了新领域时代。结果，在探索的过程中，宇宙神秘生命体斯非亚突然出现在…