莉莎做为博士的助理，每当情绪检测仪亮起红光的时候，莉莎就会按响警报，酷杰三人组出发去帮助小朋友解决情绪问题，但是小朋友的疑问千奇百怪，酷杰三人组有时候也不知道怎么办，但莉莎会帮助他们，有时候是言语点拨，有时候是让电话手表点拨酷杰三人组，有时候利用造梦机，营造一个梦境，指点酷杰三人组去解决小朋友们的烦恼。

为治疗某些疾病做医学探索，酷杰三人组作为志愿者驾驶微型飞船潜入人体进行医学性质考察。途径过程使观众直观了解人体多个重要器官，科普人体免疫细胞运作机理。

酷杰、安娜、糊涂蔡在小机器人的帮助下一起复原这些植物残本，并整理出一套全新的电子版的《植物图文大全》。他们在地球各地寻找各种不同稀有植物、名贵植物、濒危植物等等。在飞船各种新功能的帮助下，他们在高大的望天树之间架起过“飞船桥梁”，变形过“小鸟”飞到炸弹树旁边去采风、还变过“小蜜蜂”帮助小机器人拍摄各种花的花蕾……

乐阳是一个乐天向上、热爱探索的男孩，无论什么事情，他都有着浓厚的兴趣，他最喜欢的就是研究太空和宇宙生命的知识，乐阳的爸爸也是太空迷，他很认可孩子这种勇于探索的热情，也相信人类必将更多地接触到外太空，所以十分支持他去主动探索。暑假的一个晚上，乐阳在家门口看着一本讲解宇宙生命体的书，正当他眼睛累了，准备歇息一下的时候，突然…

一只井底的青蛙威尔，来到人类的世界，冒充一名被施咒的王子，帮助城堡中的小公主苏菲亚粉碎皇叔班特的阴谋，成功继承皇位，成为女王。而自己也带着爱人萝拉回归井下，告诉同伴井外的世界很大很大。