武林中的泰山北斗, 佛門弟子的聖地 - 少林寺, 何故變成了暗藏殺機之凶險地? 為替病重的少林方丈空智醫治的黃飛鴻, 與徒兒鬼腳七, 豬肉榮趕到少林寺時, 卻被拒諸門外. 鴻見寺中僧侶神色怪異, 行為處處透着古怪, 心中不祥之感漸重. 鴻在偶然的情況下重遇得高望重的空雲大師, 得悉寺內變故原委. 眼見少林正處生死存亡之秋, 玄門正宗弟子的源豈能…

軍閥混戰, 天下大亂. 凌小倩夜潛入張大帥 (陳元飾) 下榻的 "梅園", 欲殺張為父報仇之時, 竟發現張已死, 其首級更不翼而飛. "無頭將軍" 一案轟動南方. 黃飛鴻帶領眾徒入園查案, 發現 "梅園" 鬧鬼, 案情更趨複雜離奇. 為了取得證據, 懲辦真兇, 挽救無辜, 鴻與真兇展開連場生死大戰.